cnvkit
Copy number variant detection from targeted DNA sequencing
🌐 Site do projeto: https://cnvkit.readthedocs.org
Versões por repositório
| Repositório | Versão | Arquitetura | Tamanho | Download |
|---|---|---|---|---|
Exu | 0.9.12-1 | all | 18.9 MB | .deb |
Exu | 0.9.12-1 | all | 18.9 MB | .deb |
Ogum | 0.9.14-1 | all | 21.8 MB | .deb |
Ogum | 0.9.14-1 | all | 21.8 MB | .deb |
Informações do pacote
| Seção | science |
|---|---|
| Prioridade | optional |
| Mantenedor | Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging@lists.alioth.debian.org> |
| Site do projeto (upstream) | <a href="https://cnvkit.readthedocs.org" rel="noopener">https://cnvkit.readthedocs.org</a> |
| Depende de | python3-biopython, python3-matplotlib, python3-numpy, python3-pandas, python3-pomegranate (>= 0.15), python3-pyfaidx, python3-pysam, python3-reportlab, python3-scipy, python3-sklearn, python3:any, r-bioc-dnacopy |
| Fornece (Provides) | — |
| Substitui (Replaces) | — |
| Conflita (Conflicts) | — |